3日前から内くるぶしの下が痛い

その部位は足根管症候群の様に、神経や腱が押されている人は少なくないです、
しゃがむのは問題ないでしょうか、自己流で動かすと増悪でお困りの相談は少なくないです、
整形でレントゲンだけでなくMRIも詳しくお聞きしていいと思います
クスリ、注射で対応可能か詳しくお聞きしていいと思います

足根管症候群という足関節の内くるぶし付近での神経の圧迫が関係しているのかもしれません。
そこで炎症が起こっているということがあるので、ロキソニンなどの消炎鎮痛剤を服用してみて、
改善しない場合は、一度整形外科で見ていただくとよいように思います。

扁平足が原因となって生じてくることが多い、足関節内側を走行する後脛骨筋腱の炎症症状である可能性があると思います。
運動不足や体重過多、繰り返す歩行負荷あるいは走行負荷が原因となって疲労性の炎症が生じます。
整形外科を受診してみてください。

お話からは、腱鞘炎や関節炎などが疑われますので、整形外科の専門医を受診して精査していただくことをお勧めします。

後脛骨筋腱腱鞘炎かもしれません。偏平足であったりヒールを使用していませんか？インソールの使用をお勧めします。

足根管症候群の可能性もあります。
外反母趾や扁平足など無いでしょうか。

普段履いている靴のサイズがあっていないのかもしれませんが如何でしょうか？ストレッチなどが有効かもしれませんので試してみてください。お大事に。